2071 год. Человечество расширило свои границы далеко за пределы Земли, основав колонии на Венере, Марсе и даже на далёких лунах Юпитера. Однако этот период процветания был омрачён катастрофой, которая навсегда изменила облик Солнечной Системы. Техногенная авария на Луне привела к её полному разрушению, что вызвало цепную реакцию. В результате Земля была обречена на постоянные метеоритные дожди, делающие поверхность планеты непригодной для жизни. В первые же недели после катастрофы погибло почти половина человечества — 4,7 миллиарда человек. Выжившие, спасаясь от разрушения, перебрались в колонии на других планетах, оставляя Землю в руинах.

Со временем преступность в Солнечной Системе стала процветать, и синдикаты, объединившиеся в мощные организации, начали контролировать многие аспекты жизни. Для борьбы с этим правительства колоний возродили древний институт охотников за головами — профессионалов, которые занимаются поимкой самых опасных преступников. Охотники разъезжают по всей Системе, преследуя свои цели, и их жизнь — это постоянная гонка за наградой и выживанием в жестоком мире.

Спайк Шпигель и Джет Блэк — двое таких охотников, чья судьба свела их на борту космического корабля «Bebop». Их команда постепенно растёт, когда они встречают Фэй Валентайн, женщину с тёмным прошлым и огромным долгом, Радикал Эдварда, необычного гениального хакера, и Эйн, генетически модифицированную собаку с удивительными способностями. Вместе они становятся странной, но сплочённой семьёй, путешествующей по звёздным просторам, где каждый день — это новое приключение, полностью меняющее их жизни.