В Токио, где правительство ввело строгие ограничения на свободу молодежи, группа борцов за свободу, известная как "SIRRUT", решает бросить вызов системе. Их цель — Фумито Нанахара, влиятельный политик, тайно управляющий городом. Используя интернет как основное оружие, "SIRRUT" начинает расследование, чтобы раскрыть правду о Фумито и тайной организации под названием "Башня", которая проводит опасные эксперименты над людьми.

Однажды, во время попытки "SIRRUT" заманить Фумито в ловушку в метро, происходит непредвиденное: появляются загадочные монстры, атакующие пассажиров. В этот момент на помощь приходит Сая Кисараги, молодая девушка с катаной, которая не понаслышке знает о монстрах. Сая, потерявшая многое в провинции Укасима, теперь преследует Фумито, чтобы отомстить за свои страдания. Ее появление кардинально меняет ход событий, превращая борьбу "SIRRUT" в личную войну Сай против Фумито и "Башни".

С приходом Сай "SIRRUT" получает неожиданного союзника, но и новые опасности. Фумито и "Башня" не остановятся ни перед чем, чтобы скрыть свои секреты. Сая, используя свои навыки фехтования, вступает в схватку с монстрами, раскрывая все новые тайны "Башни". В этой борьбе за свободу и справедливость, Сая и "SIRRUT" должны объединить усилия, чтобы противостоять не только физическим угрозам, но и политическим махинациям Фумито. Финальная битва, где будут решены судьбы многих, только начинается.