В мире, где мутанты с уникальными способностями живут бок о бок с обычными людьми, существует группа героев, известных как Люди Икс. Их лидер, профессор Чарльз Ксавьер, собрал эту команду с целью защиты человечества от угроз, исходящих как извне, так и изнутри. Однако общество, напуганное и ненавидящее "отклонения" от нормы, часто ставит мутантов в ситуации, где им приходится выбирать между спасением мира и собственным выживанием.

После трагической потери одного из членов команды, Люди Икс решают временно прекратить свою деятельность. Год спустя, профессор Ксавьер получает тревожное сообщение о загадочном исчезновении молодой девочки-мутанта в Японии. Подозревая, что это событие может быть лишь верхушкой айсберга, он вновь собирает своих учеников и отправляет их на расследование. В этой миссии они сталкиваются с новыми врагами и старыми соперниками, каждый из которых имеет свои мотивы и цели.

По мере того как герои проникают вглубь тайны, они обнаруживают, что исчезновение девочки тесно связано с группой, называющей себя Люди Ю. Эти люди, также обладающие сверхъестественными способностями, преследуют свои собственные, часто зловещие, цели. В ходе своего расследования, Люди Икс сталкиваются с моральными дилеммами, личными трагедиями и неожиданными союзниками. В конечном итоге, они должны решить, насколько далеко они готовы зайти, чтобы защитить не только себя, но и весь мир от надвигающейся угрозы.