В 2009 году человечество оказывается втянуто в кровопролитную войну с инопланетными расами, известными как зельтране (мужская раса) и мельтране (женская раса). После того как земляне были вынуждены покинуть родную планету, они перемещаются на космической крепости Макросс, мечтая найти путь обратно на Землю и восстановить свой дом. Этот путь будет нелёгким, полон опасностей и испытаний, но надежда на возвращение горит в сердцах каждого.

Во время одного из сражений с зельтранами молодой пилот Хикару Итидзё спасает талантливую певицу Линн Минмей, которая только начинает свой путь к славе. Оказавшись на борту неисправного корабля, они проводят время вместе, постепенно сближаясь. Однако их романтический эпизод оказывается прерван, когда зельтране похищают Линн, а Хикару, вместе с офицером Мисой Хаясэ, вынуждены вернуться на Макросс, чтобы продолжить борьбу за выживание человечества.

Возвращение на Землю приносит не радость, а ужас: цивилизация землян гибнет под ударами врагов. В этот момент единственной надеждой становится древняя мелодия, записанная в прошлом, и голос Линн Минмей, который может стать ключом к перелому в войне. Хикару и Миса, объединённые общей целью, должны найти способ использовать эту музыку, чтобы спасти то, что осталось от их родной планеты. В этой борьбе за существование их связь становится не только личным испытанием, но и символом надежды на будущее.