Действие аниме разворачивается в 0097 году Вселенского Века, ровно через год после драматических событий OVA «Мобильный воин Гандам: Единорог». Мир, казалось бы, находится на грани нового начала: «Ящик Лапласа» был открыт, а права ньютайпов официально признаны. Однако, несмотря на эти глобальные перемены, общество остаётся глубоко разделённым и напряжённым. Конфликт, известный как «Инцидент Лапласа», привёл к распаду группировки «The Sleeves», последних последователей Нео-Зиона. В последней схватке два легендарных мобильных доспеха — Белый Единорог и Чёрный Лев — продемонстрировали невероятную мощь, которая пошатнула основы человеческого понимания.

После этих событий оба доспеха были запечатаны и, казалось, навсегда утрачены для истории. Мир, казалось, вернулся к своим рутине, забыв о прошлых трагедиях. Однако в этом спокойном мире внезапно происходит неожиданное событие: считавшийся утерянным два года назад третий мобильный доспех серии «Единорог» — золотой «Фенекс» — неожиданно появляется на горизонте. Этот доспех, обладающий уникальными способностями, снова вносит хаос и непредсказуемость в уже налаженные отношения между людьми и ньютайпами.

Появление «Фенекса» снова ставит под вопрос существующий мирный порядок. В этой новой главе истории «Гандама», герои предыдущих серий и новые лица оказываются вовлечены в противостояние, где сила и идеология сталкиваются снова. Каждый персонаж, каждый доспех несёт в себе свой груз прошлого, и теперь они должны решить, как использовать свои силы в этом новом конфликте. «Фенекс», с его золотым блеском и таинственными способностями, становится символом новой эры, где старые раны снова раскрываются, а надежда на мирное будущее кажется всё более и более далекой.