Действие разворачивается на борту военного корабля "Эгида", принадлежащего японской армии. Однажды, в один из обычных дней, на судне происходит шокирующее событие: обнаруживается тело, лишенное левой руки. Эта находка вызывает панику среди экипажа и поднимает вопросы о возможной угрозе, скрывающейся на корабле. Всем известно, что на борту может находиться опасный шпион, известный как "X", чье присутствие угрожает не только безопасности экипажа, но и всей страны.

Шпион "X" — это таинственная фигура, чьи коварные планы могут привести к катастрофическим последствиям. Однако, пока он не подозревает, что его секреты могут быть раскрыты. В этот момент на помощь приходит легендарный детектив Конан, чьи навыки расследования и интуиция делают его идеальным человеком для раскрытия этой загадки. Конан берется за дело с энтузиазмом, стремясь не только спасти жизни, но и предотвратить национальную катастрофу.

Сюжет аниме окунает зрителя в мир интриг, где каждая деталь может стать ключом к разгадке. Конан, с его невероятной находчивостью и непоколебимой верой в справедливость, становится главным героем, чьи действия могут изменить ход событий. Каждая загадка, каждая улика приближает его к разгадке тайны шпиона "X" и защите страны от неминуемой угрозы. Аниме предлагает зрителю окунуться в атмосферу напряженных моментов, где каждый шаг может стать решающим.