После долгих странствий Сатоши, Айрис и Дент наконец-то достигают Нью-Торк-сити, города, полного неожиданностей и тайн. Однако, их прибытие совпало с необычным событием: древние покемоны Генесекты, пробудившиеся после многовекового сна, решают сделать этот город своим новым домом. Генесекты, потерявшие связь со временем, начинают создавать хаос, превращая Нью-Торк-сити в свою колонию. Сатоши и его друзья понимают, что им предстоит непростая задача.

Первостепенной задачей для наших героев становится выяснение причины внезапного пробуждения Генесектов. Они начинают исследовать город, общаясь с местными жителями и покемонами, чтобы собрать информацию о происходящем. В ходе расследования Сатоши, Айрис и Дент сталкиваются с различными загадками и препятствиями, которые заставляют их проявить все свои навыки и смекалку. Однако, главной проблемой остается то, как избавить город от незваных гостей, не причинив вреда ни людям, ни покемонам.

В поисках решения Сатоши и его друзья обращаются за помощью к старым знакомым и новым союзникам. Вместе они разрабатывают план, который позволит вернуть Генесектов в их естественную среду обитания. Однако, для этого им придется пройти через множество испытаний и сражений. В конечном итоге, успех зависит от их способности объединиться и использовать все свои силы и таланты. Нью-Торк-сити, наполненный надеждой и страхом, становится ареной для одного из самых сложных и захватывающих приключений Сатоши и его друзей.