Прошло три года с тех пор, как герои «[anime=1313]Приключениях Дигимонов 02[/anime]» сражались за мир. Теперь они столкнулись с новыми вызовами — подростковыми проблемами, такими как сложные отношения с друзьями, любовь и учеба. Бывшие товарищи по приключениям стали чужими, их пути разошлись. В один из дней, когда Таити [八神 太一] готовился к важному футбольному матчу, а Ямато [石田 ヤマト] репетировал с группой, в Японию вернулась Мими [太刀川 ミミ] из Америки. В этот же момент в город вторгся Дигимон, и Таити оказался в ловушке. Но неожиданно появился Агумон [アグモン], который спас его.

Оказалось, что в цифровом мире произошла эпидемия, заразившая многих Дигимонов. Теперь все старые друзья-Дигимоны вернулись к своим избранникам, чтобы вместе бороться с новой угрозой. Герои, которые когда-то были едины, теперь столкнулись с огромным грузом ответственности. Страх, неуверенность и давление со стороны общества стали их постоянными спутниками. К тому же, в городе появился новый избранный ребёнок, что добавило ещё больше неопределённости и тревоги.

Несмотря на то, что герои рады встрече со своими старыми друзьями-Дигимонами, им предстоит пройти через множество испытаний. Старые связи нужно восстановить, а новые проблемы — решить. В этом их поддерживают верные друзья, которые готовы вновь встать плечом к плечу с ними. Герои понимают, что только вместе они смогут спасти не только свой мир, но и цифровой. И хотя пути каждого из них теперь разные, их общая цель остаётся неизменной — защита того, что дорого им всем.