«[Аркадия моей юности]» возвращается с новым эпизодом, продолжающим историю противостояния человечества и Иллюмидуса — могущественной империи, которая порабощает и разрушает обитаемые планеты. После окончательного поражения в войне Земля попадает под полный контроль инопланетных захватчиков, а герои, включая Харлока, объявляются врагами человечества и изгоняются с родной планеты.

Однако Иллюмидус не собирается останавливаться на достигнутом. Харлок, Тотиро и Эмеральда, известные под кодовыми номерами S-00999, S-00998 и X-00001 соответственно, становятся объектами охоты. Их имена разносятся по всей галактике, а за их головы обещают огромные награды. Теперь герои вынуждены не только бороться с Иллюмидусом, но и сбегать от тех, кто жаждет их смерти ради богатства.

В этом хаосе единственными защитниками Земли остаются Харлок и его верные соратники. Они продолжают свой путь, сталкиваясь с новыми опасностями и преградами. Каждый шаг становится все сложнее, ведь теперь они противостоят не только инопланетным силам, но и людям, которые ради выгоды готовы предать свои идеалы. В этой борьбе за свободу и справедливость герои сталкиваются с самыми мрачными сторонами человеческой природы, но не сдаются.