Микото Мисака, обладающая невероятной силой и признанная одной из лучших эсперов 5-го уровня в Академия-Сити, сталкивается с шокирующей правдой. В детстве её ДНК было похищено и использовано для создания целой армии клонов. Цель этого безжалостного эксперимента была одна — вырастить самого могущественного эспера 6-го уровня, способного пошатнуть баланс сил в мире. В процессе эксперимента многие клоны, которых Микото считала своими родными сестрами, были безжалостно использованы и потеряны.

Второй сезон «Рейлгана» погружает нас в мир, где Микото и её верная подруга Куроко [白井 黒子] сталкиваются с новыми испытаниями. Они должны разобраться в запутанной паутине лжи и предательства, которая окружает их. Каждый шаг на их пути к истине сопровождается новыми опасностями и неожиданными поворотами сюжета. Микото, у которой уже было достаточно трудностей в жизни, теперь должна найти силы не только для себя, но и для своих потерянных "сестер".

В этом сезоне зрители увидят, как глубокие раны прошлого влияют на сегодняшние решения Микото и Куроко. Они должны не только противостоять внешним угрозам, но и справиться с внутренними демонами. Каждый эпизод раскрывает новые слои характеров главных героинь, показывая их борьбу за справедливость и истину. «Рейлган» во втором сезоне становится не просто аниме о сверхъестественных способностях, а глубокой драмой о потерях, мести и надежде на лучшее будущее.