Действие аниме разворачивается в 2002 году, спустя три года после событий предыдущего фильма. Сюжет начинается с трагического инцидента, когда Рабочая бригада Организации Объединённых Наций подвергается уничтожению в Юго-Восточной Азии. Это событие становится катализатором для целой серии драматических событий, которые вскоре оказывают влияние на Японию.

В результате инцидента в Японии начинается подготовка к военному перевороту. Группа заговорщиков стремится взять власть в свои руки, что грозит стране хаосом и разрушением. В этот момент на сцену выходят герои, члены Специального Мобильного Подразделения, которые получают информацию о надвигающейся угрозе. Им предстоит сплотиться и вступить в борьбу за защиту своей страны.

Специальное Мобильное Подразделение сталкивается с непростым выбором: остановить заговорщиков или рискнуть всем ради спасения не только своих товарищей, но и всей страны. Сюжет наполнен напряжёнными моментами, где каждое решение может иметь необратимые последствия. Герои проходят через испытания, которые меняют их, но их единственная цель — защитить мир, который они знают, от разрушительных сил, стремящихся к власти.